عباس عبدی در سایت شخصی خود در پاسخ به سوالی مبنی بر این که «آیا شما طرح عبور از خاتمی را مطرح کردید»، گفت: خیر، کسی که دیدگاه عبور از خاتمی را مطرح کرد من نبودم آقای افشاری بود.
وی گفت: من در این باره مفصل انتقاد داشتم.
عبدی همچنین نوشته است که: من نسبت به مواضع هسته ای متفاوت آقای‌ها‌شمی نه تنها انتقادی ندارم که از آنها دفاع هم کرده ام.