کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

پربیننده ترین پست همین یک ساعت اخیر
برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
معاون سابق رئیس‌جمهور آمریکا: ترامپ در فضایی از فساد قرار دارد یمن: ادعای سعودی‌ها در مورد رهگیری ۲ پهپاد بر فراز مکه و مدینه دروغ و ساختگی است وزیر خزانه‌داری آمریکا: منزل را ترک و به پایگاه نظامی پناه برده‌ام! بازدید دبیر شورای عالی انقلاب فرهنگی از فدراسیون ورزش زورخانه‌ای فراخوان عراقی‌ها برای بازی با ایران:«ورزشگاه را پر کنید» کشف ۳۵۷ دستگاه ماینر غیرمجاز در خرمشهر نرخ بیکاری ایران در بهار ۱۴۰۵؛ افزایش ۲۵ درصدی بیکاری نسبت به سال گذشته تمدید مهلت ثبت‌نام آزمون کارشناسی رسمی دادگستری ۱۴۰۵ تا ۳۰ آبان حملات عربستان به پنج استان یمن طی ۲۴ ساعت وقتی کار به بهای سلامتی تمام می‌شود؛ قطع عضو ۳ کارگر در اراک مبینا علی‌نسب در جام شطرنج شانگهای مسکو به مدال برنز رسید پرونده قتل زن ۲۷ ساله در مشهد کمتر از ۱۰ روزه به کیفرخواست رسید ترامپ: اتفاقات بزرگی در حال روی دادن است! آرسن ونگر از رقابت با اینفانتینو برای ریاست فیفا کنار کشید «مجمع نمایندگان جان فدا» تاسیس شد