تاریخ:
معاون وزیر بهداشت: ۲۴۵ مرکز ما در جنگ آسیب دیده است 
درس سی و نهم
پیشبینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهمترین هدفهای فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکولهای دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روشهای آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمانبر و پرهزینه هستند.
«پیشبینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنبالههای پروتئینی در شبکههای مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.
به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهمترین هدفهای فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکولهای دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روشهای آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمانبر و پرهزینه هستند.
وی ادامه داد: بنابراین در کنار روشهای آزمایشگاهی، از روشهای محاسباتی نیز استفاده میشود. از روشهای محاسباتی که برای پیشبینی بهترین کاندیدای داروها استفاده میشود، میتوان به روشهای سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روشها میتوان داروهای تأثیرگذار را پیشبینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.
این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیشبینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیشبینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین میشود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه کشف دارو دارد.
وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا میتوان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهرهگیری از دانش اضافی موجود در مجموعه دادهها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئینها طراحی کرد؟
عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیشبینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئینها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.
لینک کوتاه: کپی لینک
شکایت برند «مجید» از استقلال؛ حکم توقیف اموال صادر شد رد شایعه گرانی نان؛ رئیس کارگروه آرد و نان: افزایش قیمت نان غیرقانونی است افشای نگاه داوران جایزه نوبل به «ارباب حلقهها» سفر مخفیانه رئیس موساد به امارات در طول جنگ علیه ایران «ذرات آشوب»؛ روایت ایستادگی در خلیج فارس، روی صحنه تئاتر شهر سخنگوی ارتش: اجازه نمیدهیم تسلیحات آمریکایی وارد پایگاههای منطقه شود نیویورک تایمز: کشتی ها از تنگه هرمز چراغ خاموش عبور میکنند علاالدین بروجردی: دستاورد تنگه هرمز را از دست نمیدهیم از نمایش تا واقعیت؛ ستاره مکزیکی سریال «تد لاسو» فوتبالیست حرفهای شد شوک به فوتبال اروگوئه؛ لوئیس سوارس از فهرست جام جهانی خط خورد بازگشت محسن مسلمان به پرسپولیس مریم نشیبا گوینده «شب بخیر کوچولو»: شاید ما پیر شده باشیم، اما صدا پیر نمیشود (+فیلم) بلیت ۳۱ میلیارد تومانی برای تماشای قهرمانی احتمالی آرسنال مجری اسکار ۹۹ انتخاب شد ایتالیا: در صورت ایجاد یک آتشبس پایدار، دو فروند مینروب به تنگه هرمز اعزام میکنیم