کمتر از دوماه پس از آنکه غلامحسین الهام رسما اعلام کرد: «اقدام انقلابی و غیر انقلابی در مورد دانشگاه آزاد متوقف شد و بحث دانشگاه آزاد بنابر دلایل و مصالحی از دستور كار رئیسجمهور خارج شده است و دولت در مسائل دانشگاه آزاد مداخلهای ندارد»، محمود احمدینژاد در محل دانشگاه علم و صنعت بار دیگر اعلام کرد: «به زودی زمان اصلاح دانشگاه آزاد فرا خواهد رسید».
به گزارش آفتاب، در پاسخ به دور جدید انتقادات شدید محمود احمدینژاد به دانشگاه آزاد، دانشگاه آزاد اسلامی اعلام کرد: «در طول حیات 25 ساله دانشگاه آزاد اسلامی، اصلاحات از اصلیترین ارکان پیشبرد امور بوده و رشد چشمگیر و معجزه آسای این دانشگاه با هزینهای حدود یک پنجم دانشگاههای دولتی نیز گواه روشنی بر این ادعا است. لذا هر گونه سیاستگذاری که در راستای بهره وری بیشتر و ارتقای کیفیت و نظارت دقیق تر باشد مورد استقبال است».
سازمان مرکزی دانشگاه آزاد اسلامی در ادامه تاکید کرده است: «بر اساس مستندات موجود و به گواهی مراکز نظارتی، شهریه دریافتی از دانشجویان در واحدهای دانشگاهی سراسر کشور فقط صرف هزینههای آموزشی، تحقیقاتی و توسعه فضاهای دانشگاه می شود و هیچ مبلغی از منابع مالی و سرمایههای دانشگاه به هیچ گروه و جریان سیاسی خارج از دانشگاه پرداخت نشده و نمیشود».
همچنین این دانشگاه در خصوص قرارداد با یک مرکز تحقیقاتی آورده است: «فعالیت های پژوهشی در تمام دانشگاه های کشور و دنیا یک ارزش و امتیاز تلقی شده و دانشگاه آزاد اسلامی نیز همانند سایر مراکز آموزش عالی بودجه ای را به فعالیت پژوهشی اختصاص می دهد لیکن همانگونه که پیشتر نیز اعلام شده است ارقام اشاره شده مقرون به صحت نبوده و قرارداد مذکور به منظور انجام بیش از 120 پروژه وسیع تحقیقاتی با رقمی در حدود یک سوم مبلغ اشاره شده در چارچوب ضوابط، با یک مرکز تحقیقاتی وابسته به نظام منعقد شده است و هیچ نقطه مبهم و پوشیده ای در توافقنامه وجود ندارد».