به فاصله تنها یکسال از آغاز فعالیت "خانهموزه شهید مرتضی مطهری" دومین رئیس آن هم از سمت خود استعفاء کرد.
سیدحسین مرتضوی در گفتگو با مهر ضمن تائید خبر کنارهگیری خود از سمت ریاست این مرکز فرهنگی گفت: بنده نهایتاً تا آخر ماه جاری در خانهموزه شهید مطهری فعالیت خواهم کرد و دیگر قصد ادامه همکاری با این مرکز را ندارم.
مسئول خانه موزه شهید مطهری درباره دلایل خود برای استعفاء از این مسئولیت جابجاییهای اخیر صورت گرفته در حوزه مدیران فرهنگی سازمان فرهنگی هنری شهرداری تهران را در تصمیم خود بیتاثیر دانسته و گفت: چون سِنی از من گذشته راحتتر با اینگونه تغییرات کنار میآیم اما قصد ادامه همکاری ندارم.
مرتضوی با اشاره به دغدغههایش برای توسعه فرهنگی خانهموزه شهید مطهری اضافه کرد: این مرکز باید یک مرکز فرهنگی باشد و به یک خانه موزه اکتفا نشود در حالی که ارادهای قصد داشت که این مرکز به همان شکل و تنها برای بازدید مردم باقی بماند.
اوایل دهه 30 همزمان با تاسیس حسینیه ارشاد استاد مطهری لازم دید در محلی نزدیکتر به این حسینیه زندگی کند و به همین دلیل در سال 45 و با کمک مالی اقوامش این خانه را به قیمت 500 تومان خرید که تا سال 55 محل زندگی، تحقیق، مطالعه و برگزاری دیدارها و جلسات وی با دیگر محققان دینی بود. این خانه حدود 450 متر مربع مساحت دارد که 290 متر زیر بنا در 2 طبقه ساختمان اصلی آن را تشکیل میدهد و چون در زمینی شیبدار واقع شده حیاط آن در دو سطح ساخته شده است.
در اردیبهشت سال 86 این خانه توسط سازمان فرهنگی، هنری شهرداری تهران خریداری، بازسازی و تجهیز شد و محدباقر قالیباف شهردار تهران همزمان با بیست و هشتمین سالگرد شهادت استاد آن را افتتاح کرد و به دلیل جمع آوری مدارک و یادمانهای بیشتر درباره استاد درهای این مرکز یکسال بعد در اردیبهشت 87 به روی عموم باز شد.
یکی از اهداف اصلی تبدیل منزل استاد مطهری به خانه موزه بدل شدن این محل به یکی از مراکز پژوهشی در حوزه نواندیشی دینی بود و در همین راستا کار فراهم کردن بانک اطلاعات کتابها و مقالات استاد و نیز تحقیقات، پایاننامهها و کتابهایی که در مورد اندیشه ایشان نوشته شده است آغاز شد.